研究所圍繞傳染病防控應用基礎研究領域，以技術鏈條為準線，構建了鏈條式技術創新服務體系，建立了公共技術服務中心，下設功能鮮明、深度融合的技術領銜、支撐為先，服務到位統籌規劃、科學管理、開放共享、服務科研提供高效優質的技術服務，為建設國際一流的研究所提供強有力的技術支撐。

　　技術中心現有冷凍透射電子顯微鏡、流式細胞儀、高分辨液相色譜質譜聯用儀、激光共聚焦顯微鏡、激光顯微切割儀、動物設施、生物安全二級專業實驗室，提供單顆粒超微結構解析、組織和細胞形態學的影像分析、流式細胞分析與分選、蛋白分離純化與鑒定、抗體疫苗的上游工藝與研發、感染細胞與動物水平實驗、基因小鼠制備、生物信息分析、病原體診斷技術研發和新發傳染病病原體分離鑒定等。服務形式主要有技術咨詢、技術服務、技術開發、技術轉讓和檢測服務。