中國共產主義青年團中國科學院上海巴斯德研究所委員會是研究所先進青年的組織,是研究所黨委的助手和后備軍,是研究所與青年學生聯系溝通的牢固橋梁紐帶。
自2014年12月成立以來,團委在研究所黨委的領導下,發揚共青團的優良作風,繼承光榮傳統,艱苦奮斗、勤奮工作,不斷開創共青團工作新局面。目前研究所團委設有團支部3個,團委委員7名。